286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1693 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 115 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  96.52 
 
 		 115 aa  222  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  73.91 
 
 		 123 aa  156  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  70.54 
 
 		 110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  57.27 
 
 		 113 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  57.27 
 
 		 113 aa  127  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  56.36 
 
 		 113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  55.05 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  52.63 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  53.98 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  50.43 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  52.99 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  52.99 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  46.09 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  54.17 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  52.99 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  51.35 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  57.83 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  50.89 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  50.45 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  53.33 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  54.44 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  50.45 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  58.14 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  54.76 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  52 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  48.31 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  50.89 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  50.89 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  51.19 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  55.42 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  46.73 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  51.72 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  41.75 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  37.82 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  45.56 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  41.53 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  44.94 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  40.19 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1182  preprotein translocase, YajC subunit  48.94 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.714716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  43.64 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  43.64 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  40.37 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  41.51 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  41.57 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  35.85 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  33.96 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  38.83 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  46.34 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  35.23 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  39.6 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  45.12 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  45.12 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  45.12 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  45.12 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  45.12 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  45.12 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  45.12 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  31.19 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  31.19 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  33.03 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  35.23 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  42.06 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  33.02 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  38.3 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  41.12 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  41.25 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  31.19 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  31.19 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  31.19 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  36.45 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  31.19 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  35.96 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  37.11 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  38.95 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  40.23 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  34.09 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  34.09 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  31.19 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  42.31 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  37.78 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>