120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1367 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  46.09 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  48.03 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  34.13 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  41.67 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  35.11 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  36.25 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  48.33 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  40.85 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  39.02 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  42.25 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  42.25 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  42.25 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  38.81 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  33.82 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  40.85 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  31 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  33.05 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  31.17 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  34.83 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  32.58 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  38.57 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  31.17 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  36.78 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  36.78 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  36.36 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  34.18 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  35.29 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  28.21 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  37.33 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  36.62 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  35.53 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  35.53 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  30.93 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  36.67 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  34.72 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  29.87 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0835  preprotein translocase, YajC subunit  60 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  39.19 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  41.27 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  32.1 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  39.34 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  34.13 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  29.11 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  31.65 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  43.4 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  32.43 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  40.35 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  34.67 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0715  preprotein translocase, YajC subunit  28.77 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0769  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000195822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  32.89 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  34.21 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  31.58 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  25.68 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  25.64 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  30.69 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  28.57 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  34.21 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  31.58 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  31.17 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  31.58 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  34.67 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  31.25 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  34.21 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  41.51 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  31.94 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  30.67 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  34.43 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>