294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1965 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 102 aa  205  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  59.04 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  51.69 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  44.3 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  49.35 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  44.68 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  48.05 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  44.58 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  45.95 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  44.16 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  41.54 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  43.66 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  39.47 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  40.79 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  35.42 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  46.77 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  39.19 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  48.15 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  37.66 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  51.85 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6249  preprotein translocase, YajC subunit  41.33 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  37.66 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  36 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  36.67 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  36.78 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  37.88 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  35.06 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  35.9 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  34.52 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  41.46 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  41.46 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  36 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  39.19 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  34.18 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  37.18 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  38.67 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  47.27 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  43.1 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  45.07 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  34.62 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  34.62 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  37.93 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  37.04 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  36 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  36 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  36 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  33.75 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  39.06 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  40 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  34.15 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>