274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12913 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
97 aa  194  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  57.78 
 
 
91 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  55 
 
 
102 aa  92.8  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  47.37 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  45.12 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  46.34 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  46.25 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  46.25 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  47.37 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  47.37 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  47.37 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  47.37 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  47.37 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  47.37 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  46.05 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  43.37 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  43.37 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  44.3 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  46.05 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  46.05 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  41.77 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  42.17 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  45.35 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  41.77 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  43.42 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 
109 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  41.33 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  43.04 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6249  preprotein translocase, YajC subunit  43.68 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  45.76 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  38.46 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  37.63 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 
91 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  39.44 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  37.18 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  42.65 
 
 
99 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  38.27 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  37.04 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  32.97 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  43.48 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  40.58 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  40.62 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  35.79 
 
 
123 aa  60.1  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  48 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  41.18 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  45.45 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  37.21 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  37.68 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  40.98 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  43.28 
 
 
115 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  45.16 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  43.28 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  28.3 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  38.81 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  44.64 
 
 
93 aa  57  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  32.93 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  41.33 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  41.33 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>