276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1348 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  41.41 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  39.22 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  34.31 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  35.45 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  41 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  35.71 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  45.57 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  38.39 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  36.61 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  34.45 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  42.35 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  38.61 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  33.68 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  36.11 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1790  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167941  hitchhiker  0.00454541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  34 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  30.93 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  30.93 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  35.78 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  35.24 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  32.26 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  36.9 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  34.94 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  26.05 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  31.76 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  32.99 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  30.84 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  32.91 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  31.19 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  31.19 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  35 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  31.19 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  37.36 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  32.94 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  36.89 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  31.63 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  31.13 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  28.89 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  35 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  35 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  33.68 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  33.94 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  37.62 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  35 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  33.02 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  35.79 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  32.08 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  35.63 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  32.08 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  32.97 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1182  preprotein translocase, YajC subunit  37.36 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.714716  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  37.78 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  35.87 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  39.39 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  34.69 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  43.66 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  33.72 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  36.25 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  35.53 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1605  preprotein translocase, YajC subunit  35.21 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.257286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  30.19 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  26.32 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  28.95 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  34.44 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  43.66 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  29.76 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  31.13 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  31.13 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  31.13 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  31.13 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  35.96 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  30.19 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  35.53 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  34.88 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>