289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0416 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
150 aa  306  4e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  45.54 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  48.84 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  48.28 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  48.28 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  48.28 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  48.28 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  39.82 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  48.28 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  47.13 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  45.57 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  45.57 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  40.7 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  43.68 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  38.24 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  38.38 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 
118 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  33.61 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  36.78 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  38.14 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  37.93 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  31.73 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  32.31 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  35.29 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  32.97 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  40.22 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  37.5 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  37.5 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  37.97 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  32.26 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  37.65 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  37.65 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  36.73 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36.73 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  36.17 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  36.17 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  34.62 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  36.17 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  36.17 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  36.17 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  36.17 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  42.05 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  37.88 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  38 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  37.18 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  35.96 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  35.87 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  26.83 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  37.04 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  34.83 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  33.67 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  44.62 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  32.69 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  38.75 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  40.51 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  28.05 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  38.75 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  28.05 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  36.05 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  36.05 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  30.91 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  36.28 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  42.59 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  42.59 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  31.76 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  31.63 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  31.63 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  34.88 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  30.63 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  35.48 
 
 
123 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  39.24 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  26.81 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  34.58 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  31.36 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  42.59 
 
 
107 aa  57.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  38.82 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  31.36 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  32.95 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  33.72 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  33.7 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  35.79 
 
 
115 aa  57  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  27.35 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>