292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1358 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
90 aa  179  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  64.29 
 
 
95 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  60.26 
 
 
93 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1121  preprotein translocase, YajC subunit  55.95 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00511918  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  44.19 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  45.07 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  42.86 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  52.63 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  52.63 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  37.93 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  35.63 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  46.25 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  45.68 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1790  preprotein translocase, YajC subunit  51.81 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167941  hitchhiker  0.00454541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  36.78 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  45.57 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  40.24 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  36.78 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  40 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  40.74 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  39.02 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  37.78 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  43.59 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  37.93 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  35.63 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  37.93 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  37.93 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  43.04 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  36.49 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  37.93 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  43.04 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  42.47 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  45.07 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  40.23 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  37.93 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  32.56 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  37.93 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  36.78 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  43.66 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 
105 aa  67  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  45.95 
 
 
107 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0145  protein translocase subunit yajC  49.37 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0155516  hitchhiker  0.00195414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  36.78 
 
 
86 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  40.96 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  36.78 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  44.93 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  35.8 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  40.51 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  37.21 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  47.89 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  36.49 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  35.63 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  36.49 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>