299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6327 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4927  preprotein translocase, YajC subunit  71.25 
 
 		 84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354289  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  55.1 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  45.79 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  55.21 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  45.26 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  47.73 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  43.88 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  45.45 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  43.88 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 118 aa  84.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  41.41 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  44.33 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  40.37 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  44.68 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  41.38 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  40.37 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  46.75 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  46.91 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  46.91 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  46.91 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  46.91 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  46.75 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  44.87 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  40.23 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  46.48 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  41.33 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  45.68 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  40.86 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  40.86 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  45.07 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6249  preprotein translocase, YajC subunit  45.78 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  40.2 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  39.56 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  48.48 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  36.73 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  48.65 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  35.23 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  31.82 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  45.68 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  40.78 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  43.56 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  42.68 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  41.46 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  36.56 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  50.88 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  34.51 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  36.78 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  39.74 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  40.79 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  38.3 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  38.74 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  34.69 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  40.54 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  37.84 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  35.87 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  40.45 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  39.73 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  37.84 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  37.37 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  39.42 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  39.19 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  39.08 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  41.03 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  41.33 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  41.33 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  41.33 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>