297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4927 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4927  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 84 aa  169  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354289  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  71.25 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  55.56 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  51.35 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  45.57 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  47.95 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  47.37 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  48.1 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  44.3 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  47.5 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  47.44 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  47.44 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  44.87 
 
 		 106 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  48.72 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  53.62 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  53.03 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  41.98 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  38.96 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  38.96 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  39.51 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  44.3 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  44.29 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6249  preprotein translocase, YajC subunit  47.89 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  44.93 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  46.38 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  46.38 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  47.22 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  44.93 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  47.83 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  43.04 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  41.56 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 		 86 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  42.86 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  39.02 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  37.04 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  43.37 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  44.93 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  44.93 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  41.89 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  41.1 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  42.03 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  42.31 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  39.73 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  45.07 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  37.18 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  42.03 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  42.03 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>