292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0530 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
154 aa  313  7e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  37.82 
 
 
150 aa  111  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  41.96 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  38.32 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  43.3 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  29.7 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  37.25 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  35.64 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  33.01 
 
 
120 aa  73.6  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  35.48 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  34.41 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  35.92 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 
91 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  40.37 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  33.01 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  40.79 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  44.12 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  41.79 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  37.8 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  46.84 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  45.07 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  45.16 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  50 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2436  hypothetical protein  44.44 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000321077  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  40.54 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  33.66 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  51.67 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  37.68 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  44.26 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  29.17 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  41.38 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  35.48 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  49.06 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  37.14 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  48.44 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  40.3 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  41.79 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  33 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  33 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  33 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  42.42 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  35.16 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6249  preprotein translocase, YajC subunit  37.93 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  45.76 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  33 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  45.45 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  40.32 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  29.92 
 
 
133 aa  60.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  44.64 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  35.23 
 
 
94 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  42.19 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  43.94 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  43.1 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  48 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  42.37 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4927  preprotein translocase, YajC subunit  44.3 
 
 
84 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354289  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  36.14 
 
 
114 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>