121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2436 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2436  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  219  9e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000321077  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  51.02 
 
 
113 aa  93.6  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  40.82 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  42.16 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  38.55 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  31.63 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  39.36 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  40.74 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  39.51 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  37.23 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0243  preprotein translocase, YajC subunit, putative  38.1 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000181073  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  37.04 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  37.04 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  39.51 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  38.2 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  37.97 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  40.51 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  37.18 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  38.46 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  40.96 
 
 
86 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  39.76 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  39.76 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  39.76 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  29.27 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  31.71 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  40.21 
 
 
132 aa  50.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  29.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  27.37 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  44 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  33.87 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  31.76 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0454  preprotein translocase subunit  34.62 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00883496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  31.4 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  38.18 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  33.77 
 
 
112 aa  47  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  35.48 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  35.48 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  31.11 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  35.48 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  35.48 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  35.48 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  30.61 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4927  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354289  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  34.12 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  35.48 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  35.48 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  35.48 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  31.11 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  28.75 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  32.22 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  29.63 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  29.11 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  38.33 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  26.58 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  31.25 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  27.85 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  28.4 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  30.59 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  31.51 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  31.51 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  30.49 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  31.51 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  34.62 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  32.58 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  34.94 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  31.58 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  32.98 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  26.19 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1605  preprotein translocase, YajC subunit  32.89 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.257286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  32.98 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  29.67 
 
 
120 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  29.67 
 
 
120 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  26.88 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>