147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3175 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  45.74 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  42.16 
 
 		 181 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  43.37 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  35.92 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  39.6 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  44.29 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  39.74 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  40.57 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  44.59 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  44.59 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  41.89 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  38.75 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  36.71 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  36.46 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  34.07 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  39.81 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  41.43 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  36.05 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  39.19 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  35.9 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  34.07 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  35.16 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  33.77 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  35.37 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  39.44 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  37.78 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  29.63 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  37.84 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  32.1 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  30.95 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  37.84 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  46.58 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  35.44 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  31.17 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  34.65 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  35.14 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  32.5 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  29.49 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  37.66 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  32.05 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  30.59 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  27.27 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  29.41 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  29.41 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  31.11 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  29.41 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  30.77 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  29.41 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  32.53 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  29.76 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  29.76 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  29.76 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  28.24 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0319  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  29.41 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  36.27 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  30.67 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  33.73 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>