202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1694 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 133 aa  256  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  62.5 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  49.4 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  43.93 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  44.74 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  40.4 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  42.55 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  46.88 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  36.46 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  38.55 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  40.21 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  49.33 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  43.66 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  41.43 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  41.38 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  35.87 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  38.46 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  31.78 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  36.36 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  43.04 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  32.89 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  39.73 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  40.4 
 
 		 179 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  42.19 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  34.21 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  32.89 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  35 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  35.44 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  39.39 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  39.8 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  32.35 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  29 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  34.41 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  29 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  39.74 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  38.81 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  36.47 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 105 aa  50.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  37.11 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  33.78 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  28.21 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  36.99 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  30.49 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  43.66 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  38.36 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  33 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  35.04 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  34.31 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  37.31 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  32.91 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  32.53 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  38.57 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  39.39 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  31.19 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  27 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>