111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1372 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  60.28 
 
 		 179 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  37.88 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  40.4 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  39.08 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  40.4 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  35.96 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  37.93 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  38 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  35.9 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  33.61 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  34.71 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  36.96 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  35.48 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  31.62 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  33.68 
 
 		 93 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  34.15 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  28.74 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  37.68 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  30.49 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  32.91 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  35.96 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  37.18 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  31.18 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  32.91 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  25 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  31.96 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  31.65 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  31.03 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  35.63 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  36.67 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  37.84 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  35.9 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  37.21 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  29.7 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  32.32 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  30.43 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  32.14 
 
 		 125 aa  48.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  30.68 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  38.67 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  38.81 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  28.8 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  35.71 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  30.59 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  34.48 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  35.16 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  30.38 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  28 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  25.15 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  32.93 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  27.59 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  29.67 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  29.67 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  33.75 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  30.51 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  25 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  27.27 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  33.78 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  30.85 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  32.1 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  34.41 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  30 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  31.17 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  38.16 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  29.73 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  24.21 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  27.85 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  29.2 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  30.23 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  29.89 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  30.93 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  29.89 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  32.56 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 115 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 		 113 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  30 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 		 113 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  28.75 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  33.72 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  28.79 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  34.38 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 		 106 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  35.53 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  35.06 
 
 		 101 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  35.53 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  35.53 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  34.62 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>