299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2062 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
113 aa  226  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  65.22 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  47.06 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  45.65 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  45.56 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  49.33 
 
 
113 aa  80.1  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  58.97 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  41.86 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  43.36 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  38.39 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  45.78 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  35.59 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  41 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  43.84 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  36.78 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  37.21 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  41.33 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  37.63 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  44.16 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  39.56 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  35.11 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  39.53 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  39.02 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  35.71 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  41.98 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  32.95 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  34.07 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  36.05 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  42.42 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  38.71 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  41.76 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  39.09 
 
 
179 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  32.97 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  32.97 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  36.26 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  30.49 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  34.69 
 
 
118 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  32.26 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 
168 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  36.78 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  35.92 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  40.95 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  34.34 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  34.75 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  31.87 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  34.52 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  32.97 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  31.4 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  35.63 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  32.29 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  34.07 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  35.05 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  36.47 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  38.03 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  28.18 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  38.1 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>