58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1995 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 119 aa  237  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  48.45 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  44.09 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  39.77 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  48.54 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  41.12 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  42.25 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  39.05 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  37.18 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  38.98 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  32.99 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  37.78 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  33.67 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  33.98 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  35.9 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  30.12 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  35.48 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  33.77 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  27.78 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  32.98 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0715  preprotein translocase, YajC subunit  27.38 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  32.11 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  33.7 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  31.36 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  32.35 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  26.21 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  34.41 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  34.38 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1067  preprotein translocase, YajC subunit  30.38 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  32.22 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  33.01 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  29.75 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  31.17 
 
 		 109 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  29.41 
 
 		 116 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  29.17 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  28.21 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  28.21 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  29.63 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  31.03 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  30.68 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  29.41 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  26.23 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>