91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1797 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
128 aa  251  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  51.81 
 
 
119 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  40.32 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  45.88 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  50.54 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  53.62 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  41.77 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  37.14 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  37.14 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  37.14 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  39.19 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  34.23 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  35 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  35.8 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  39.71 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  37.04 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  34.29 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  37.04 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  35.4 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  37.5 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  35.14 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  39.47 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  35.53 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  36.62 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  43.28 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  43.28 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  37.84 
 
 
106 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  27.17 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  40.3 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  30.48 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  32.39 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  31.51 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  31.25 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  27.71 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  35.62 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  35.21 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  35.21 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  35.21 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  35.21 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  35.21 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  35.21 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  35.21 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  30 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  36.99 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  36.92 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  31.34 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  30.3 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  35.62 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  31.91 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  32.86 
 
 
109 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  32.89 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 
143 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  41.94 
 
 
110 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  35.62 
 
 
110 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  33.8 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  41.94 
 
 
110 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  32.05 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  30.67 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  28.99 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  29.58 
 
 
90 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  27.38 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  35.53 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  35.48 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  32.88 
 
 
92 aa  40  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  32.1 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  32.84 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  29.63 
 
 
110 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  32.1 
 
 
120 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  35.38 
 
 
115 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>