124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13970 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 126 aa  250  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  34.13 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  41.12 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  35.96 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  37.21 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  37.68 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  35.37 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  40.48 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  35.79 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  26.19 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  46.34 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  34.83 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  37.97 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  32.53 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  32.53 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  35.78 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3437  preprotein translocase, YajC subunit  36.21 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.616709  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  31.52 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  31.25 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  36.67 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  32.77 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  34.41 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  30.39 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  32.95 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  33.66 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  37.36 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  31.11 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  30.34 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  37.04 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  29.07 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  32.18 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  36.26 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  30.68 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  26.83 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  30.68 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  28.09 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  32.91 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  29.21 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  31.43 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  36.25 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  33.73 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  32.53 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  32.22 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  34.72 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  32.63 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  26.6 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  30.53 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  37.97 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  28.74 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  29.67 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  32.22 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  35.56 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  34.41 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  30 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  32.97 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  31.18 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  32.56 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  28.92 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  26.74 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  28.92 
 
 		 90 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  35.8 
 
 		 108 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 		 97 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  28.92 
 
 		 90 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0715  preprotein translocase, YajC subunit  27.5 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  31.58 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  34.44 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  32.58 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  34.44 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>