274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2355 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  43.59 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  35.05 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  37 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  36.17 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  31.87 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  26.58 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  31.4 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  32.95 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  39.19 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  37.84 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  36.49 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  36.49 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  31 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  32.1 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  36.56 
 
 		 114 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  34.62 
 
 		 109 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  36.49 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  35.53 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  37.33 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  35.53 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  40.62 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  38.16 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  30.21 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  37.84 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  33.98 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  34.18 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  35.44 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  32.32 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  35.21 
 
 		 106 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  30.86 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  30.11 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  32.05 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  32.05 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  28.99 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  34.18 
 
 		 120 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  34.18 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 		 108 aa  52.4  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  29.35 
 
 		 125 aa  52  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  35.62 
 
 		 116 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  36.99 
 
 		 131 aa  51.6  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  32 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  29 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  29.67 
 
 		 116 aa  51.2  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  32.91 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  32.91 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  28.24 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 		 109 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  32.43 
 
 		 109 aa  50.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  28.38 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  40.51 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  35.21 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  35.21 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3437  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.616709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  28.24 
 
 		 110 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  34.67 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  34.21 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  31.08 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  30.68 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  29.73 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  30.86 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  30.38 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  29.63 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  30.38 
 
 		 90 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  31.17 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  28.24 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  33.75 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  32.5 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  28.4 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0145  protein translocase subunit yajC  35.23 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0155516  hitchhiker  0.00195414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  34.57 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  28.4 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  30.38 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  28.4 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  27.06 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  29.21 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  31.08 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  31.25 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>