More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2112 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 134 aa  265  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  58.75 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  45.28 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  47.19 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  47.19 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  43.62 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  52.11 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  33.02 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  45.88 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  43.59 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  39.02 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  39.02 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  34.75 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  38.04 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  37.63 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  41.98 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  47.44 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  40.22 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  43.33 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  35.19 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  40.32 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  36.78 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  40.24 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  31.91 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  35.29 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  30 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  38.2 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  38.67 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  41.35 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  37.5 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  32.2 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  40.24 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  34.91 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  42.67 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  42.67 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  34.31 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  31.96 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  40.74 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  38.16 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  25.56 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  35.8 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  36.36 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  35.71 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  35.9 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  34.44 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  37.97 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  32.04 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  31.53 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  34 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  31.68 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  40.74 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  37.37 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  34.12 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  31.03 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  32.94 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  30.43 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  34.09 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  34.57 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  32.58 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  34.72 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  47.54 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  32.14 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  32.14 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  36.17 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  31.96 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  45.9 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  25.97 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  30.11 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  34.07 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  41.33 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>