48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5143 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 179 aa  350  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  72.64 
 
 		 155 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  45.78 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  43.68 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  40.4 
 
 		 133 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  33.05 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  36.67 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  38.75 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  36.14 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 102 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  32.06 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  29.91 
 
 		 123 aa  52.4  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  30.93 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  35.11 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  46.55 
 
 		 1198 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  31.53 
 
 		 127 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  32.98 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  37.68 
 
 		 131 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  33.6 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  36.25 
 
 		 118 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  35.92 
 
 		 115 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  26.58 
 
 		 102 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  27.78 
 
 		 118 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  39.73 
 
 		 111 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  26.67 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  27.45 
 
 		 112 aa  45.1  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  38.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  32.63 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  22.99 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  29.66 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  25 
 
 		 119 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  28.16 
 
 		 109 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  29.57 
 
 		 125 aa  42.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  27.27 
 
 		 106 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  31.63 
 
 		 111 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  32.5 
 
 		 93 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  22.79 
 
 		 168 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 128 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  30.56 
 
 		 109 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  24.1 
 
 		 109 aa  41.6  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  25.51 
 
 		 108 aa  40.8  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  36.11 
 
 		 114 aa  40.8  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  26.67 
 
 		 111 aa  40.8  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>