227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0840 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 102 aa  206  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  58.75 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  48.19 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  36.46 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  50.63 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  36.45 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  32.26 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  35.56 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  33.66 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  35.23 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  37.35 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  30.43 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  36 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  32.91 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  39.56 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  41.77 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  29 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  38.96 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  35.71 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  38.24 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  35.9 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  36.14 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  29.76 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  33.68 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  33.77 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  34.88 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  31.33 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  32.22 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0117  preprotein translocase subunit YajC  41.43 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000495791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  35.9 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  35.14 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  29.87 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  32.58 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  32.5 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  36.23 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  32.05 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  30.68 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  36.49 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  26.97 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  34.44 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  32 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  35.56 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  30.12 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  32.95 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  35.79 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  32.91 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  32.95 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  34.25 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  31.25 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  33.8 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  29.67 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  29.76 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  33.78 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  29.63 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  33.78 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  33.78 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  33.78 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  33.78 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  33.78 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  33.78 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  30 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  30.77 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  32.18 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  30.49 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  32.89 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  34.21 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  25.88 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>