More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2092 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 102 aa  203  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  48.81 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  59.38 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  54.84 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  47.73 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  40.45 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  43.59 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  43.59 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  37.36 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  40.7 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  43.42 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  35.05 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  34.31 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  40.7 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  36.78 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  36.78 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  41.77 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  44.58 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  37.08 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  42.05 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  35.85 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  35.9 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  41.25 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  42.03 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  37.84 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  37.84 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  33.77 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  40 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  36.47 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  45.12 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  37.63 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  43.48 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  35 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  36.78 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  35.96 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  34.94 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  40.58 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  40.58 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  33.73 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  41.54 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  31.71 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  35 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  34.09 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  36.9 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  32.93 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  31.91 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>