295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1403 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 109 aa  218  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  53 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  52.56 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  47 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  51.72 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  55.84 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  48.89 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  50.57 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  53.25 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  49.35 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  44.44 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  40.62 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  41.77 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  38.75 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  40.48 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  46.05 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  38.75 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  47.5 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  40.23 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  37.63 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  38.67 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  44.87 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  39.18 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  38.46 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  40.79 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  38.16 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  41.25 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6249  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  39.02 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  39.18 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  40.7 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  38.64 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  39.36 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  38.64 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  38.64 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  38.27 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  38.64 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  38.64 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  38.64 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  38.64 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  41.03 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  41.03 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  47.83 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  44.3 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  40.7 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  36.96 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  34.34 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  43.04 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  38.82 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  43.37 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  39.47 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  43.04 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  34.62 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  35.35 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>