44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12608 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 		 115 aa  231  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  68.09 
 
 		 110 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  79.01 
 
 		 115 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  74.07 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  74.07 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  74.07 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  43.84 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  46.75 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  35.11 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  49.25 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  35.92 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  35.8 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  33.98 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  33.98 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  37.84 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  36.08 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1067  preprotein translocase, YajC subunit  30.67 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  35.78 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  31.76 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  33.78 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  30.99 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  35.29 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  30.99 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  38.67 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  30.88 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  29.58 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  31.67 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  26.74 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  33.8 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  31.07 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  31.76 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  45.9 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  25 
 
 		 92 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>