104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3817 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
110 aa  223  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  78.63 
 
 
115 aa  169  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  91.57 
 
 
117 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  91.57 
 
 
117 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  91.57 
 
 
117 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  68.09 
 
 
115 aa  140  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  39.18 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  43.93 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  42.06 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  46.05 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  40.85 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  35.87 
 
 
128 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  40.51 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  38.37 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  37.78 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
126 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  42.25 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  38.57 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  41.33 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  34.21 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  36.17 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1067  preprotein translocase, YajC subunit  33.8 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  32.14 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  28.4 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  33.77 
 
 
108 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  40.85 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  32.84 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  45.59 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  36.92 
 
 
110 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  34.38 
 
 
102 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  33.85 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  37.66 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  42.31 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  34.38 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  34.38 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  37.88 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  39.13 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  31.51 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  31.51 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  32.35 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0769  preprotein translocase, YajC subunit  29.49 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000195822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  30.77 
 
 
109 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  28.99 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  29.87 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  31.34 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  32.32 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  38.18 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  31.58 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  30.88 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  29.87 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  30.88 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  30.53 
 
 
123 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3437  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 
110 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.616709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  31.17 
 
 
110 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  39.19 
 
 
117 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  34.55 
 
 
118 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  31.17 
 
 
110 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  30.26 
 
 
90 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  30.65 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  31.88 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  34.88 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  36.92 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1790  preprotein translocase, YajC subunit  28.4 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167941  hitchhiker  0.00454541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  28.95 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  32.35 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  29.69 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0319  preprotein translocase, YajC subunit  35.53 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  30.3 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  29.69 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>