118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2314 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  79.05 
 
 
110 aa  165  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  77.98 
 
 
115 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  63.89 
 
 
115 aa  140  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  42.16 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  43.88 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  43.06 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  44.71 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  38.89 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  34.96 
 
 
126 aa  60.1  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  40.79 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  44.44 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  29.87 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  41.43 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  41.43 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  34.83 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  31.71 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  33.82 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  32.89 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  39.06 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1067  preprotein translocase, YajC subunit  32.39 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  34.34 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  39.44 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  36.92 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  41.1 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  30 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  32.91 
 
 
181 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  36.49 
 
 
113 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
106 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  32.43 
 
 
159 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  33.77 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  41.82 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  32.89 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  45.59 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  38.46 
 
 
105 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  41.33 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  31.94 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  36.28 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  37.14 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0769  preprotein translocase, YajC subunit  30.16 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000195822  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  32.35 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  32.05 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  33.87 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0319  preprotein translocase, YajC subunit  34.15 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  29.76 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  32.26 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1790  preprotein translocase, YajC subunit  28.92 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167941  hitchhiker  0.00454541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  31.58 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  30 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 
112 aa  43.5  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  33.33 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  32.98 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  31.03 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  24.71 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  31.76 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  29.89 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  33.8 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  30.88 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  39.06 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  32.81 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  29.89 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  30.26 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  26.55 
 
 
137 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  30.3 
 
 
119 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  29.49 
 
 
120 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  30.26 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  34.15 
 
 
111 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  29.49 
 
 
109 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  30.26 
 
 
90 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>