130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 125 aa  249  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  60.8 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  51.16 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  46.24 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  43.4 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  48.78 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  44 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  43.68 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  36.63 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  40.45 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  39.36 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  33.62 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  34.69 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  33.66 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  33.66 
 
 		 113 aa  57  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  35.29 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  34.44 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  37.66 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  33.72 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  28.83 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  30.85 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  34.52 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  35.56 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  33.7 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  40.7 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  30.09 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  32.2 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  34.57 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  36.76 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  36.21 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  39.68 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  28.7 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  37 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  37.5 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  33.82 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  32.22 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  36.36 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  33.82 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  35.82 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  32.89 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  36.61 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  34.38 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  32.43 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  34.44 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0319  preprotein translocase, YajC subunit  39.68 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  33.82 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  38.57 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  29.59 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  32.97 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  35.9 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  33.04 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  33.77 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  30.91 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  31.58 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  27.05 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  32.53 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  34.88 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  35.19 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  27.62 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  32.97 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  36.67 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  31.17 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  33.73 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  31.71 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  29.49 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  34.72 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  32.04 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  34.72 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  24.53 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  27.27 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  31.25 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  31.25 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  30.77 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  31.33 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  33.77 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>