99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1669 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
132 aa  266  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  48.03 
 
 
129 aa  100  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  49.57 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  56.25 
 
 
119 aa  82  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  37.93 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  41.11 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  38.4 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  44.32 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  41.23 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  36.26 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  49.38 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  40.85 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  34.26 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
86 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  33.81 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  37.97 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  34.88 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 
86 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 
86 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0454  preprotein translocase subunit  34.26 
 
 
145 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00883496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 
86 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  35.37 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  33.01 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  33.01 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  33.01 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  37.8 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  42.19 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  35.8 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0243  preprotein translocase, YajC subunit, putative  32.43 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000181073  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1314  preprotein translocase subunit YajC  40.32 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  35.38 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  27.91 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2436  hypothetical protein  39.53 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000321077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  32.08 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  29.07 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  30.86 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0715  preprotein translocase, YajC subunit  27.4 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  40.35 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  41.27 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  33.75 
 
 
155 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  37.1 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  34.18 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  33.77 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 
115 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  35 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  35 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  36.23 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  30.67 
 
 
110 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  34.92 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  37.1 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  34.92 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  34.92 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  34.92 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  29.23 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  33.82 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
114 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  33.87 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  39.22 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  30.67 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  34.85 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  40.74 
 
 
101 aa  40.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  40.38 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0319  preprotein translocase, YajC subunit  45.83 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  35.09 
 
 
109 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
93 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>