284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1906 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 116 aa  233  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  63.11 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  55.17 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  55.17 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  39.58 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1117  preprotein translocase, YajC subunit  39.82 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  39.13 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  39.13 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  36.14 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  34.69 
 
 		 106 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  30.86 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  41.86 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  37 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  37 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  37 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  37 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  38.3 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  35.79 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  36 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  37.23 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  35 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  33.68 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  34.41 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  34.41 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  34.41 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  32.99 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  36.46 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  36.26 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  40.7 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  32.65 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  41.25 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  39.24 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  32.65 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  40 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  38.04 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  32.93 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  35.42 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  34.44 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  39.76 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  35.11 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  34.44 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  34.44 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  34.44 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  34.44 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  34.44 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  34.44 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  42.11 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  35.71 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  31.52 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  31.52 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  31.52 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  31.52 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  31.52 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  44.44 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  31.52 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  31.52 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  31.52 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  37.8 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  32.93 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  40.7 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  37.8 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  39.29 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  32.61 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  37.5 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  30.21 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  32.35 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  37.11 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  34.34 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  35.8 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  30.85 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  30.85 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  41.33 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  34.94 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  34.94 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  32.61 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  30.85 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  41.25 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  34.07 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  32.29 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  30.85 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  30.85 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  45.95 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  42.22 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  31.52 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  34.07 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>