55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0835 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0835  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 133 aa  271  1.0000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0454  preprotein translocase subunit  46.88 
 
 		 145 aa  106  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00883496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  32.93 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  33.68 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  30.08 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  37.88 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  33.64 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  32.08 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  26.09 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  36.51 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2436  hypothetical protein  37.18 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000321077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  38.98 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  26.92 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  38.98 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  31.94 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  31.15 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  32.79 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  32.79 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  38.24 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  35.85 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  32.79 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  37.18 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  42 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  31.43 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  31.43 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  27.87 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  26.47 
 
 		 168 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  35.82 
 
 		 129 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  35.85 
 
 		 110 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  35.85 
 
 		 110 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 		 108 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  35.19 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  26.09 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  41.43 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  41.43 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  41.43 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  25.78 
 
 		 154 aa  40.8  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  41.43 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  41.43 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  41.43 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  35.85 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  27.56 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  39.24 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  41.43 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  41.43 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  31.03 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0243  preprotein translocase, YajC subunit, putative  28.57 
 
 		 112 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000181073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>