104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3472 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3472  recombinase  100 
 
 		 436 aa  895    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3120  recombinase  58.94 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2288  recombinase  56.76 
 
 		 544 aa  515  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3086  Recombinase  54.92 
 
 		 437 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.776561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0609  Recombinase  53.17 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0625  Recombinase  53.17 
 
 		 440 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0695  Recombinase  49.77 
 
 		 437 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.736618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1166  hypothetical protein  41.79 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  22.82 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.75 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.71 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.61 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  23.58 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.55 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.62 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  23.36 
 
 		 534 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  22.57 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.61 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.25 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  23.65 
 
 		 534 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.61 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.91 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  20.75 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  21.5 
 
 		 612 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  22.42 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.57 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  23.79 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  20.85 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  21.55 
 
 		 546 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  20.85 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.6 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  20.85 
 
 		 665 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25.17 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  23.49 
 
 		 532 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  22.66 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  25.16 
 
 		 531 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  22.56 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  21.75 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  21.43 
 
 		 613 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  20 
 
 		 542 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  20 
 
 		 542 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  19.7 
 
 		 542 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.05 
 
 		 521 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  20.61 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  22.73 
 
 		 489 aa  54.7  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  22.85 
 
 		 561 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  22.29 
 
 		 561 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  21.78 
 
 		 549 aa  53.9  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  21.92 
 
 		 441 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  23.57 
 
 		 526 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  21.52 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  23.9 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  22.36 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 		 519 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  21.11 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  27.53 
 
 		 534 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  22.49 
 
 		 544 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  21.25 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  21.54 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  21.52 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  23.5 
 
 		 524 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  22.31 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  22.07 
 
 		 511 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  25.81 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  22.91 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  20.17 
 
 		 479 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  20.17 
 
 		 479 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.3 
 
 		 506 aa  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  21.07 
 
 		 529 aa  50.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  22.98 
 
 		 526 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.37 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  23.4 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  20.52 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.56 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.64 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  22.76 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  28.38 
 
 		 743 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  22.3 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  25.43 
 
 		 607 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  22.1 
 
 		 553 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  21.78 
 
 		 539 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  21.13 
 
 		 513 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  22.98 
 
 		 550 aa  47  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  21.11 
 
 		 547 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  20.69 
 
 		 528 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  22.42 
 
 		 299 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  23.3 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  22.07 
 
 		 482 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  19.23 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.71 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  22.33 
 
 		 511 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  21.28 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  23.14 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  25.65 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  21.41 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  21.41 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  21.26 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  22.8 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  18.02 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>