107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0609 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0609  Recombinase  100 
 
 
440 aa  896    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0625  Recombinase  99.55 
 
 
440 aa  892    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3086  Recombinase  67.73 
 
 
437 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.776561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3120  recombinase  59.23 
 
 
430 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2288  recombinase  57.3 
 
 
544 aa  510  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3472  recombinase  53.17 
 
 
436 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0695  Recombinase  55.94 
 
 
437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.736618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1166  hypothetical protein  40.99 
 
 
441 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  25.37 
 
 
441 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  22.92 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  21.82 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.1 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  22.55 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  24.46 
 
 
534 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  21.36 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.16 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  22.12 
 
 
527 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  21.72 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.16 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.41 
 
 
537 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.53 
 
 
613 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.08 
 
 
534 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  22.95 
 
 
547 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  23.61 
 
 
441 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  22.3 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.5 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  23.92 
 
 
534 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  21.9 
 
 
561 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24.5 
 
 
534 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.8 
 
 
443 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.17 
 
 
537 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.17 
 
 
534 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  23.55 
 
 
489 aa  63.2  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.19 
 
 
521 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.64 
 
 
665 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  20.36 
 
 
509 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  23.19 
 
 
500 aa  60.5  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  21.19 
 
 
520 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.91 
 
 
498 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  20.56 
 
 
522 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  25.49 
 
 
493 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  22.79 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  22.99 
 
 
526 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  22.55 
 
 
511 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  22.73 
 
 
299 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  19.25 
 
 
532 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  22.65 
 
 
555 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  21.5 
 
 
482 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  21.59 
 
 
612 aa  53.9  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.22 
 
 
528 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  23.22 
 
 
474 aa  53.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  21.52 
 
 
519 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  20.29 
 
 
546 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  23.29 
 
 
544 aa  53.5  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  19.83 
 
 
522 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  21.82 
 
 
490 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  25.37 
 
 
524 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  22.1 
 
 
343 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  21.52 
 
 
553 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  22.68 
 
 
528 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 
449 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 
449 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.83 
 
 
462 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  23.92 
 
 
540 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  29.01 
 
 
519 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  18.24 
 
 
515 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  22.18 
 
 
474 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  21.35 
 
 
445 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  22.82 
 
 
561 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.55 
 
 
586 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  24.2 
 
 
449 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  23.84 
 
 
462 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0850  DNA recombinase, putative  20.97 
 
 
543 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  21.5 
 
 
484 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  21.69 
 
 
460 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  23.14 
 
 
465 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  21 
 
 
542 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  21.85 
 
 
568 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  21 
 
 
542 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  20.67 
 
 
542 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  21.5 
 
 
484 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  23.56 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  22.62 
 
 
421 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.45 
 
 
506 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  20.79 
 
 
558 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  21.92 
 
 
487 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  24.2 
 
 
322 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0854  DNA recombinase, putative  20.97 
 
 
543 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  18.14 
 
 
488 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  23.15 
 
 
430 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  22.12 
 
 
500 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  21.1 
 
 
549 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  20.07 
 
 
429 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  19.87 
 
 
444 aa  46.6  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  23.26 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  20.61 
 
 
540 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  20.57 
 
 
534 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  22.68 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  23.39 
 
 
517 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  18.82 
 
 
543 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>