106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3120 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3120  recombinase  100 
 
 		 430 aa  885    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2288  recombinase  73.06 
 
 		 544 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3086  Recombinase  62.01 
 
 		 437 aa  564  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.776561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3472  recombinase  58.94 
 
 		 436 aa  555  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0609  Recombinase  59.23 
 
 		 440 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0625  Recombinase  59.45 
 
 		 440 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0695  Recombinase  56.98 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.736618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1166  hypothetical protein  44.77 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.38 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.1 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.47 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.1 
 
 		 613 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.16 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.08 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.41 
 
 		 534 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25 
 
 		 665 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.61 
 
 		 537 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.68 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.68 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.68 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  26.11 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  23.13 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.08 
 
 		 534 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.42 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.42 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  23.99 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.19 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  24.3 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.78 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.27 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  20.8 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  20.8 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.16 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  23.99 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.34 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  22.57 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  21.14 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  20.81 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  22.92 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  22.35 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  20.26 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  19.88 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  21.15 
 
 		 534 aa  56.6  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0025  resolvase  24.61 
 
 		 511 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.712822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  20.59 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  20.26 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  21.59 
 
 		 474 aa  55.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.26 
 
 		 520 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.34 
 
 		 523 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  24.74 
 
 		 460 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  22.17 
 
 		 546 aa  53.9  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  20.39 
 
 		 612 aa  53.5  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.87 
 
 		 511 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  23.65 
 
 		 568 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.27 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  19.93 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  20.07 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  22.06 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  22.06 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  22.68 
 
 		 561 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  21.99 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  23.59 
 
 		 523 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  20.49 
 
 		 522 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  22.51 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  24.15 
 
 		 321 aa  50.4  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  22.01 
 
 		 475 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  23.86 
 
 		 549 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.88 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  21.73 
 
 		 547 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.16 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  19.93 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  20.51 
 
 		 546 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  21.98 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  22.34 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  21.79 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  26.63 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  22.02 
 
 		 539 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  27.88 
 
 		 519 aa  47.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  20.99 
 
 		 465 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  18.44 
 
 		 543 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  22.55 
 
 		 493 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  19.56 
 
 		 500 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  28 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  20.6 
 
 		 553 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  22.17 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  20.56 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  23.64 
 
 		 343 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  21.72 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  22.82 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  19.07 
 
 		 521 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  22.46 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  23.75 
 
 		 552 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  20.88 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  21.58 
 
 		 526 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  21.13 
 
 		 586 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  21.03 
 
 		 485 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  22.69 
 
 		 462 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  25.15 
 
 		 550 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>