More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1905 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1905  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 		 517 aa  1055    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000727256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3748  DNA polymerase III subunit alpha  54.96 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302108  normal  0.449775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4439  nucleic acid-binding OB-fold tRNA/helicase-type protein  57.75 
 
 		 451 aa  440  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3770  DNA polymerase III subunit alpha  57.03 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3718  DNA polymerase III subunit alpha  56.76 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4900  DNA polymerase III subunit alpha  53.21 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0570  DNA polymerase III subunit alpha  53.66 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.931815  normal  0.0207496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  52.86 
 
 		 1162 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  47.04 
 
 		 1171 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  46.92 
 
 		 1171 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  43 
 
 		 1165 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  47.35 
 
 		 1172 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  44.82 
 
 		 1165 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  46.33 
 
 		 1172 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  46.04 
 
 		 1172 aa  312  7.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  46.76 
 
 		 1172 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  42.55 
 
 		 1165 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  45.63 
 
 		 1165 aa  309  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  41.77 
 
 		 1139 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  39.72 
 
 		 1134 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  39.88 
 
 		 1182 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  41.42 
 
 		 1260 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  39.76 
 
 		 1155 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  39.44 
 
 		 1164 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  42.46 
 
 		 1156 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  37.73 
 
 		 1075 aa  242  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3857  DNA polymerase III, alpha subunit  39.77 
 
 		 1296 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  38.02 
 
 		 1145 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  37.7 
 
 		 1156 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  40 
 
 		 1159 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  38.36 
 
 		 1155 aa  230  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  39.71 
 
 		 1225 aa  231  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  38.35 
 
 		 1195 aa  230  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  38.71 
 
 		 1165 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  42.12 
 
 		 1157 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7110  DNA polymerase III subunit alpha  34.36 
 
 		 1189 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.10411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  38.04 
 
 		 1184 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  38.51 
 
 		 1174 aa  226  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10990  DNA polymerase III subunit alpha  37.61 
 
 		 1191 aa  226  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.997232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  40.44 
 
 		 1173 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  39.57 
 
 		 1156 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  38.58 
 
 		 1175 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.04 
 
 		 1165 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  32.19 
 
 		 1190 aa  224  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  38.19 
 
 		 1272 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  37.35 
 
 		 1177 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  36.28 
 
 		 1143 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  36.28 
 
 		 1143 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  36.31 
 
 		 1151 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  37.28 
 
 		 1132 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  35.69 
 
 		 1180 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  34.49 
 
 		 1174 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  39.27 
 
 		 1155 aa  217  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  34.25 
 
 		 1177 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  35.07 
 
 		 1279 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  38.01 
 
 		 1179 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  38.91 
 
 		 1149 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  35.42 
 
 		 1180 aa  212  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  34.15 
 
 		 1177 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  36.56 
 
 		 1160 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2892  DNA polymerase III alpha subunit  35.17 
 
 		 1173 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0503022  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  33.81 
 
 		 1188 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  34.13 
 
 		 1189 aa  209  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0340  DNA polymerase III, alpha subunit, interruption-C  33.98 
 
 		 783 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  34.4 
 
 		 1149 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3245  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 1185 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  35.43 
 
 		 1176 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  35.91 
 
 		 1183 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  33.16 
 
 		 1173 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3172  DNA polymerase III subunit alpha  36 
 
 		 1175 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.450877  hitchhiker  0.0000979148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  35.2 
 
 		 1178 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1606  DNA polymerase III, alpha subunit  35.53 
 
 		 1187 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.667733  normal  0.417005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  37.61 
 
 		 1262 aa  206  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  35.75 
 
 		 1139 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  34.38 
 
 		 1181 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  35.48 
 
 		 1153 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21370  DNA-directed DNA polymerase III PolC  35.94 
 
 		 1166 aa  204  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  35.44 
 
 		 1170 aa  203  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  37.23 
 
 		 1127 aa  203  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2399  DNA polymerase III subunit alpha  34.38 
 
 		 1190 aa  203  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351088  normal  0.331114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2993  DNA polymerase III, alpha subunit  33.85 
 
 		 1180 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5743  DNA polymerase III subunit alpha  35.45 
 
 		 1176 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12723  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  35.14 
 
 		 1170 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  34.8 
 
 		 1190 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5053  DNA polymerase III subunit alpha  32.47 
 
 		 1179 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384157  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  37.27 
 
 		 1145 aa  200  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  32.14 
 
 		 1168 aa  200  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  32.99 
 
 		 1607 aa  200  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13490  DNA polymerase III subunit alpha  34.71 
 
 		 1198 aa  200  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.17 
 
 		 1170 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  33.15 
 
 		 1176 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10390  DNA polymerase III subunit alpha  34.26 
 
 		 1193 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.146518  normal  0.0814814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2376  DNA polymerase III subunit alpha  35.17 
 
 		 1178 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51094 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0898  DNA polymerase III, alpha subunit  35.28 
 
 		 1278 aa  197  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.816492  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1086  DNA polymerase III subunit alpha  34.1 
 
 		 1181 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  36.58 
 
 		 1159 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1262  DNA polymerase III, alpha subunit  31.65 
 
 		 1188 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.875559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  36.39 
 
 		 1159 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  34.74 
 
 		 1185 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05648  DNA polymerase III subunit alpha  33.25 
 
 		 1196 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000434171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>