More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4900 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4900  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 		 449 aa  924    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3770  DNA polymerase III subunit alpha  62.28 
 
 		 448 aa  591  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3718  DNA polymerase III subunit alpha  62.05 
 
 		 448 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3748  DNA polymerase III subunit alpha  52.89 
 
 		 450 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302108  normal  0.449775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4439  nucleic acid-binding OB-fold tRNA/helicase-type protein  53.32 
 
 		 451 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0570  DNA polymerase III subunit alpha  49.11 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.931815  normal  0.0207496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  49.4 
 
 		 1162 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1905  DNA polymerase III subunit alpha  53.21 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000727256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  42.07 
 
 		 1171 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  43.3 
 
 		 1172 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  43.3 
 
 		 1172 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  43.47 
 
 		 1165 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  41.63 
 
 		 1172 aa  344  2e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  44.18 
 
 		 1165 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  41.39 
 
 		 1172 aa  339  5e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  43.47 
 
 		 1165 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  44.86 
 
 		 1165 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  41.15 
 
 		 1171 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  42.94 
 
 		 1075 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  38.71 
 
 		 1155 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  39.13 
 
 		 1164 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  35.87 
 
 		 1145 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  41.16 
 
 		 1139 aa  246  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  35.59 
 
 		 1165 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  39.4 
 
 		 1134 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  41.77 
 
 		 1151 aa  243  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  41.32 
 
 		 1156 aa  243  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  41.25 
 
 		 1225 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  39.32 
 
 		 1184 aa  235  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  38.61 
 
 		 1156 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  33.89 
 
 		 1175 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  37.93 
 
 		 1155 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  41.12 
 
 		 1155 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  38.7 
 
 		 1157 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  36.91 
 
 		 1160 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  37.84 
 
 		 1159 aa  219  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  35.25 
 
 		 1159 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  37.35 
 
 		 1156 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  37.97 
 
 		 1173 aa  217  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  36.69 
 
 		 1182 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  36.96 
 
 		 1183 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0255  DNA polymerase III, alpha subunit  38.44 
 
 		 1322 aa  214  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  33.94 
 
 		 1177 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  36.12 
 
 		 1143 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  36.12 
 
 		 1143 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  38.2 
 
 		 1190 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  34.39 
 
 		 1159 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  33.94 
 
 		 1177 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  37.04 
 
 		 1181 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  35.75 
 
 		 1130 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  37.69 
 
 		 1179 aa  209  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  33.8 
 
 		 1607 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3857  DNA polymerase III, alpha subunit  35.29 
 
 		 1296 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.59 
 
 		 1165 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0340  DNA polymerase III, alpha subunit, interruption-C  32.94 
 
 		 783 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  33.77 
 
 		 1262 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  34.97 
 
 		 1127 aa  206  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5053  DNA polymerase III subunit alpha  34.11 
 
 		 1179 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384157  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10990  DNA polymerase III subunit alpha  33.13 
 
 		 1191 aa  206  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.997232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7110  DNA polymerase III subunit alpha  30.27 
 
 		 1189 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.10411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  35.2 
 
 		 1177 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  34.85 
 
 		 1186 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  34.99 
 
 		 1260 aa  203  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2399  DNA polymerase III subunit alpha  37.5 
 
 		 1190 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351088  normal  0.331114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1606  DNA polymerase III, alpha subunit  35.69 
 
 		 1187 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.667733  normal  0.417005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3245  DNA polymerase III, alpha subunit  33.44 
 
 		 1185 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  36.14 
 
 		 1174 aa  200  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  31.27 
 
 		 1190 aa  199  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5743  DNA polymerase III subunit alpha  35.63 
 
 		 1176 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  31.57 
 
 		 1145 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  31.1 
 
 		 1182 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  34.55 
 
 		 1178 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  34.7 
 
 		 1180 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  33.86 
 
 		 1162 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  34.8 
 
 		 1188 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  34.34 
 
 		 1158 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  30.75 
 
 		 1158 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2892  DNA polymerase III alpha subunit  33.77 
 
 		 1173 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0503022  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  33.01 
 
 		 1153 aa  196  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 1180 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1086  DNA polymerase III subunit alpha  33.64 
 
 		 1181 aa  196  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  37.65 
 
 		 1139 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  31.96 
 
 		 1257 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  29.72 
 
 		 1176 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  29.64 
 
 		 1154 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  32 
 
 		 1174 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22680  DNA polymerase III, alpha subunit  36.51 
 
 		 1181 aa  193  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.149072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2993  DNA polymerase III, alpha subunit  32.09 
 
 		 1180 aa  193  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  34.76 
 
 		 1173 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21370  DNA-directed DNA polymerase III PolC  35.49 
 
 		 1166 aa  192  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  36.07 
 
 		 1195 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  34.04 
 
 		 1132 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2620  DNA polymerase III, alpha subunit  32.44 
 
 		 1183 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  35.17 
 
 		 1189 aa  192  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  34.71 
 
 		 1148 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0898  DNA polymerase III, alpha subunit  34.7 
 
 		 1278 aa  191  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.816492  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1296  DNA polymerase III, alpha subunit  35.51 
 
 		 1181 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  34.71 
 
 		 1148 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  39.51 
 
 		 1149 aa  190  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  35.84 
 
 		 1272 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>