More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2993 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  36.74 
 
 		 1160 aa  703    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  36.66 
 
 		 1160 aa  702    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  34.92 
 
 		 1237 aa  645    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  37.24 
 
 		 1170 aa  738    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  42.14 
 
 		 1155 aa  858    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  35.59 
 
 		 1174 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  34.72 
 
 		 1228 aa  707    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  36.71 
 
 		 1149 aa  769    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  36.11 
 
 		 1165 aa  710    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  36.45 
 
 		 1108 aa  689    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  36.04 
 
 		 1186 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  39.48 
 
 		 1200 aa  738    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  36.71 
 
 		 1164 aa  703    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  36.04 
 
 		 1158 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  35.84 
 
 		 1173 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  36.36 
 
 		 1108 aa  689    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  36.19 
 
 		 1108 aa  685    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  36.19 
 
 		 1108 aa  686    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3107  DNA polymerase III subunit alpha  76.86 
 
 		 1191 aa  1865    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438164  normal  0.971034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  35.37 
 
 		 1148 aa  668    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  35.04 
 
 		 1148 aa  664    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  36 
 
 		 1173 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  36.11 
 
 		 1247 aa  637    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  36.34 
 
 		 1156 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  58.52 
 
 		 1188 aa  1391    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  39.27 
 
 		 1172 aa  774    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  34.74 
 
 		 1454 aa  681    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  35.26 
 
 		 1168 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  37 
 
 		 1158 aa  717    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  36.09 
 
 		 1173 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  35.38 
 
 		 1157 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  40.83 
 
 		 1156 aa  857    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  35.66 
 
 		 1510 aa  706    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  39.98 
 
 		 1172 aa  774    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  36.14 
 
 		 1176 aa  725    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  40.2 
 
 		 1172 aa  776    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  41.21 
 
 		 1155 aa  861    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  38.24 
 
 		 1165 aa  780    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  35.15 
 
 		 1158 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  36.36 
 
 		 1108 aa  689    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  38.31 
 
 		 1186 aa  742    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  37.49 
 
 		 1165 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  35.3 
 
 		 1174 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  35.87 
 
 		 1170 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  43.28 
 
 		 1156 aa  891    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  37.49 
 
 		 1165 aa  740    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  38.61 
 
 		 1210 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  61.06 
 
 		 1183 aa  1431    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  60.9 
 
 		 1249 aa  1431    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  35.67 
 
 		 1174 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  35.03 
 
 		 1173 aa  703    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  35.18 
 
 		 1185 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  35.69 
 
 		 1149 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  41.74 
 
 		 1225 aa  892    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  36.04 
 
 		 1159 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  34.78 
 
 		 1151 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  36.1 
 
 		 1168 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  35.41 
 
 		 1168 aa  664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1214  DNA polymerase III, alpha subunit  35.9 
 
 		 1247 aa  636    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.69236  normal  0.734793 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.8 
 
 		 1170 aa  723    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  39.52 
 
 		 1159 aa  822    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  35.51 
 
 		 1157 aa  683    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  61.87 
 
 		 1177 aa  1496    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  76.86 
 
 		 1191 aa  1865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  41.72 
 
 		 1165 aa  840    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  38.15 
 
 		 1155 aa  731    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  35.04 
 
 		 1173 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  35.63 
 
 		 1194 aa  728    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  35.76 
 
 		 1158 aa  685    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  36.17 
 
 		 1158 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  36.17 
 
 		 1158 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  36.42 
 
 		 1182 aa  702    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  36.45 
 
 		 1158 aa  684    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  41.38 
 
 		 1130 aa  859    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  36.53 
 
 		 1147 aa  640    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  36.07 
 
 		 1160 aa  690    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  37.12 
 
 		 1173 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  57.06 
 
 		 1185 aa  1342    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3636  DNA polymerase III subunit alpha  76.75 
 
 		 1183 aa  1869    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  39.75 
 
 		 1164 aa  837    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  36.04 
 
 		 1195 aa  672    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  36.31 
 
 		 1158 aa  703    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  60.46 
 
 		 1190 aa  1412    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  38.38 
 
 		 1331 aa  710    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  39.75 
 
 		 1184 aa  840    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  55.49 
 
 		 1183 aa  1277    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  35.94 
 
 		 1157 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  76.86 
 
 		 1191 aa  1865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2961  DNA polymerase III, alpha subunit  36.3 
 
 		 1173 aa  664    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.078928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  77.05 
 
 		 1182 aa  1894    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  35.81 
 
 		 1162 aa  708    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  37.63 
 
 		 1175 aa  750    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  39.95 
 
 		 1157 aa  828    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  36.34 
 
 		 1157 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  41.28 
 
 		 1181 aa  835    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  39.29 
 
 		 1200 aa  733    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  36.41 
 
 		 1183 aa  690    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  37.42 
 
 		 1165 aa  743    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  37.23 
 
 		 1165 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  39.27 
 
 		 1172 aa  773    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>