More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0340 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  45.59 
 
 		 1145 aa  662    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  50.76 
 
 		 1186 aa  784    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  43.72 
 
 		 1134 aa  681    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  57.95 
 
 		 1145 aa  910    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  46.77 
 
 		 1075 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  41.48 
 
 		 1156 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  46.3 
 
 		 1148 aa  702    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  56.96 
 
 		 1181 aa  906    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  47.7 
 
 		 1139 aa  721    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  44.64 
 
 		 1225 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0340  DNA polymerase III, alpha subunit, interruption-C  100 
 
 		 783 aa  1601    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  44.51 
 
 		 1190 aa  641    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  56.65 
 
 		 1159 aa  878    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  41.73 
 
 		 1139 aa  631  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  44.42 
 
 		 1127 aa  624  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  43.93 
 
 		 1130 aa  619  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  43.74 
 
 		 1156 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  45.02 
 
 		 1155 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  43.34 
 
 		 1155 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  43.18 
 
 		 1159 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  43.88 
 
 		 1157 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  45.67 
 
 		 1155 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  42.8 
 
 		 1156 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  43.57 
 
 		 1122 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  43.56 
 
 		 1184 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  42.92 
 
 		 1177 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  41.84 
 
 		 1164 aa  568  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  40.36 
 
 		 1159 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  39.58 
 
 		 1190 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  43.81 
 
 		 1179 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2376  DNA polymerase III subunit alpha  39.9 
 
 		 1178 aa  558  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51094 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  40.49 
 
 		 1175 aa  558  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  40.68 
 
 		 1174 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  40.52 
 
 		 1177 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  42.65 
 
 		 1173 aa  555  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5743  DNA polymerase III subunit alpha  40.37 
 
 		 1176 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  40.2 
 
 		 1182 aa  555  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  40.52 
 
 		 1177 aa  551  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  40.34 
 
 		 1149 aa  545  1e-154  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  38.43 
 
 		 1165 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  38.87 
 
 		 1180 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  39.72 
 
 		 1174 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  39.32 
 
 		 1151 aa  544  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2620  DNA polymerase III, alpha subunit  39.13 
 
 		 1183 aa  544  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  39.22 
 
 		 1183 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  39.22 
 
 		 1249 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  38.82 
 
 		 1165 aa  544  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  41.12 
 
 		 1158 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7110  DNA polymerase III subunit alpha  39.92 
 
 		 1189 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.10411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  41.91 
 
 		 1180 aa  538  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  41.15 
 
 		 1257 aa  537  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  40.77 
 
 		 1262 aa  535  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  39.94 
 
 		 1161 aa  538  1e-151  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  40.77 
 
 		 1165 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16450  DNA polymerase III subunit alpha  39.5 
 
 		 1183 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0617237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  39.33 
 
 		 1165 aa  535  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  37.45 
 
 		 1176 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  38.7 
 
 		 1168 aa  531  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  41.32 
 
 		 1162 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  38.39 
 
 		 1143 aa  529  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  38.39 
 
 		 1143 aa  531  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11580  DNA polymerase III subunit alpha  38.54 
 
 		 1184 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2892  DNA polymerase III alpha subunit  39.47 
 
 		 1173 aa  532  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0503022  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  38.67 
 
 		 1165 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  39.75 
 
 		 1165 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05648  DNA polymerase III subunit alpha  39.09 
 
 		 1196 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000434171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  39.43 
 
 		 1173 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0153  DNA polymerase III subunit alpha  41.37 
 
 		 1193 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0174  DNA polymerase III subunit alpha  41.23 
 
 		 1193 aa  528  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.224841  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3172  DNA polymerase III subunit alpha  38.79 
 
 		 1175 aa  529  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.450877  hitchhiker  0.0000979148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  38.83 
 
 		 1195 aa  528  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  38.67 
 
 		 1182 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  38.12 
 
 		 1170 aa  525  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  39.92 
 
 		 1172 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1086  DNA polymerase III subunit alpha  37.8 
 
 		 1181 aa  525  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10990  DNA polymerase III subunit alpha  40.65 
 
 		 1191 aa  523  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.997232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  39.63 
 
 		 1178 aa  525  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  40.14 
 
 		 1172 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  39.1 
 
 		 1154 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  37.76 
 
 		 1170 aa  523  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  38.57 
 
 		 1168 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5053  DNA polymerase III subunit alpha  39.14 
 
 		 1179 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384157  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  39.34 
 
 		 1171 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0145  DNA polymerase III subunit alpha  37.23 
 
 		 1185 aa  520  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.789646  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  39.36 
 
 		 1165 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  40.97 
 
 		 1174 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  41.89 
 
 		 1159 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1582  DNA polymerase III subunit alpha  38.24 
 
 		 1185 aa  522  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  36.92 
 
 		 1155 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  36.12 
 
 		 1173 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10390  DNA polymerase III subunit alpha  39.66 
 
 		 1193 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.146518  normal  0.0814814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  36 
 
 		 1185 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  37.9 
 
 		 1160 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.39 
 
 		 1170 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  38.29 
 
 		 1160 aa  518  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  37.83 
 
 		 1165 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  38.03 
 
 		 1160 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  37.9 
 
 		 1160 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  37.9 
 
 		 1160 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  38.11 
 
 		 1185 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>