87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1342 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  276  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  47.06 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  41.61 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  46.85 
 
 		 189 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  38.14 
 
 		 166 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  42.61 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  39.5 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  40.48 
 
 		 176 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  43.86 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  39.68 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  38.69 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  35.34 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  36.75 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  35.34 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  36.75 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  36.75 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  41.07 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  36.75 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  40.18 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  42.71 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  34.48 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  35.71 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  33.62 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  37.19 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  35.48 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  32.46 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  37.36 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  36.94 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  33.04 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  31.37 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  38.05 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  27.27 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  27.27 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  39.13 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  25.83 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  31.86 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  35.56 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  31.3 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  37.35 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  37.35 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  37.35 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  37.35 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  37.35 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  36.28 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  37.35 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  31.58 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  40.96 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  38.67 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  36.61 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  36.61 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  32.5 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  36.14 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  27.35 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  29.91 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  38.16 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  38.67 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  29.01 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  31.82 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  28.24 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  38.24 
 
 		 154 aa  50.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  36.84 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  30.3 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  26.61 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2238  hypothetical protein  38.03 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000319661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  34.57 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  32.17 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  30.09 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  33.04 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  30.4 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  28.24 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  30.17 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  29.46 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  25.22 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3894  hypothetical protein  24.79 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  29.59 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  30 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  36 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  30.17 
 
 		 144 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  47.37 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  34.52 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35 
 
 		 279 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  22.39 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2596  hypothetical protein  33.75 
 
 		 95 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292698  normal  0.0948228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>