40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2801 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  212  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  35.11 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  38.14 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  33.65 
 
 
166 aa  60.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  37.11 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  31.58 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  41.67 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  33.65 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  27.88 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  30.85 
 
 
150 aa  50.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  32.65 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  31.58 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  33.77 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  29.17 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  28.12 
 
 
135 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  40.74 
 
 
159 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  40.74 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  28.12 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  28.12 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  29.41 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  32.98 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  27.38 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  38.89 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  38.89 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2069  hypothetical protein  32.1 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.473334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  24.47 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  30.38 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  37.68 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  41.3 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  23.23 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  27.47 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4901  hypothetical protein  35.14 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  40.58 
 
 
154 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  26.53 
 
 
191 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  43.14 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  27.36 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  36.23 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>