75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3683 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  280  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  47.11 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  40.94 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  46.28 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  43.7 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  39.01 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  35.9 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  32.48 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  33.06 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  32.64 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  40.38 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  32.2 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  32.79 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  36.89 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  31.15 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  31.06 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  27.19 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  31.54 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  38.46 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  31.06 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  32.69 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  35.11 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  31.73 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  31.19 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  35.11 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  29.01 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  36.71 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  27.27 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  35.44 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  31.71 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  35.44 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  39.24 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  23.73 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  30.53 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  30.47 
 
 		 173 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  29.9 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  28.87 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  27.73 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1540  hypothetical protein  26.53 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.110674  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  29.06 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  27.38 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  30.65 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  37.11 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  39.02 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  28.32 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  25.44 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  30.4 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  35.53 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  29.79 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  29.41 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  27.43 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  27.43 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  34.04 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  32.17 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  32.17 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  29.57 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  35.06 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  25.29 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  29.17 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  28.38 
 
 		 127 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  22.88 
 
 		 140 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  26.67 
 
 		 146 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2069  hypothetical protein  26.76 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.473334  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  26.32 
 
 		 190 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  29.79 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  32 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>