40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0873 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  97.67 
 
 		 138 aa  153  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  68.6 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  60.71 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  60.71 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  66.67 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  51.85 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  48.84 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  35.71 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  39.02 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  34.57 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  35.53 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  34.52 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1540  hypothetical protein  31.16 
 
 		 198 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.110674  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  34.88 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  34.12 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  33.72 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  34.52 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  32.47 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  35 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  30.95 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  34.12 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  34.12 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  31.17 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  32.1 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  32.1 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  31.25 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  36.14 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  32.53 
 
 		 150 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  30.95 
 
 		 143 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  29.76 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  36.14 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  32.94 
 
 		 174 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  30.59 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  30.67 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>