57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2117 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  274  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  97.06 
 
 		 136 aa  252  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  59.5 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  48.2 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  57.02 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  55.63 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  48.03 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  47.11 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  60.71 
 
 		 86 aa  94  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  45.63 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  41.07 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1540  hypothetical protein  32.75 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.110674  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  33.06 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  37.8 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  32.2 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  32.2 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  32.2 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  29.41 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  35.4 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  34.51 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  28.69 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  33.63 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  33.63 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  35.9 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  35.16 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  37.63 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  35.04 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  31.43 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  29.52 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  29.91 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  33.77 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  36.73 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  32.47 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  33.67 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  29.52 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  29.55 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  32.47 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  26.98 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  31.52 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  37.97 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  26.19 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  34.02 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  32.89 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  28.67 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  26.67 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  30.34 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  28.12 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  37.68 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  29.29 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  31.52 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  29.13 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  34.04 
 
 		 107 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  31.58 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  29.87 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>