65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5846 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  34.11 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  30.5 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  30.5 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  32.53 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  34.58 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  34.19 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  26.47 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  30.7 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  37.93 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  32.58 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  31.03 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  30.5 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  32.48 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  31.03 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  32.95 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  31.17 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  31.96 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  33.72 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  31.61 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  31.46 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  30.92 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  29.73 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  32.56 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  35.44 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  27.93 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  27.93 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  34.57 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  29.06 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  32.91 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  30.84 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  30.86 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  28.24 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  25.81 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  29.07 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  27.35 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  27.78 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  29.47 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  27.03 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  29.8 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  28.1 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  41.18 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  29.63 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  33.9 
 
 		 108 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  32.38 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3894  hypothetical protein  26.09 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  28.78 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  32.73 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  29.05 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  34.48 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  27.56 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  34.55 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  36.51 
 
 		 109 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  22.86 
 
 		 166 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  26.26 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  26.35 
 
 		 175 aa  40.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>