42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1396 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  59.22 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  36.21 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  32.47 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  45.28 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  39.66 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  43.1 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  42.11 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  44.23 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  29.33 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  34.48 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40.68 
 
 		 279 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  28.07 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  35.23 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  32.76 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  29.23 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  34.33 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  32.76 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  34.09 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  38 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  34.09 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  34.09 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  39.29 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  42.11 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  34.09 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  34.09 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  33.9 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  28.33 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  40.74 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  40.74 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  26.32 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  32 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  26.32 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  27.78 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  32 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  45 
 
 		 162 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>