27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3123 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  45.71 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  43.4 
 
 		 107 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  29.58 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  37.08 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  33.63 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  28.93 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  29.33 
 
 		 108 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  39.62 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  29.07 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  29.41 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  29.36 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  29.36 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  29.36 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  29.36 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  29.36 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  33.8 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  27.93 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  34.52 
 
 		 176 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  34.52 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  27.38 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  34.62 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  30.12 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  26.51 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  27.16 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  27.71 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  26.51 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>