32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5186 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  52.34 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  43.4 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  33.64 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  42.86 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  42.47 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  38.57 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  39.62 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  43.4 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  34.04 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  31.82 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  25.96 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  29.59 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  33.78 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  32.53 
 
 		 176 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  32.53 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  32.56 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  25.96 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  32.26 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  37.74 
 
 		 167 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  32.98 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2273  hypothetical protein  42.31 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0784666  hitchhiker  0.00253392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  32.26 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  35 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  31.33 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  33.82 
 
 		 149 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>