16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2273 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2273  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0784666  hitchhiker  0.00253392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  45.61 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  43.86 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  43.33 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  47.37 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  38.6 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  38.33 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  34.55 
 
 		 135 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  34.55 
 
 		 135 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  36.21 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  42.31 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  38.3 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  37.04 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  36.21 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  36.21 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>