68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0530 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  273  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  273  5e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  87.88 
 
 
132 aa  234  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  80.74 
 
 
135 aa  224  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  38.6 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  35.71 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  32.46 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  31.3 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  35.29 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  35.29 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  35.29 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  30.65 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  30.65 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  34.78 
 
 
176 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  34.78 
 
 
174 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  34.78 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  29.41 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  31.9 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  27.43 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  32.48 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  32.76 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  29.37 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  38.89 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  29.91 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  33.63 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  31.9 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  31.62 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  26.72 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  37.68 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  30.83 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  30.25 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  30.83 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  27.87 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  31.9 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  37.68 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  32.76 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  31.88 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  23.14 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  35.21 
 
 
159 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  22.22 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  32.35 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  28.12 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  32.35 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  27.43 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  25.22 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  22.06 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  29.01 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2238  hypothetical protein  29.73 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000319661  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  26.55 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  28.92 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  23.28 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2273  hypothetical protein  34.55 
 
 
62 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0784666  hitchhiker  0.00253392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  25.64 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  35.71 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  27.18 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  28.95 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.82 
 
 
279 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  34.78 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  26.77 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  37.25 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  34.29 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  28.92 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  28.92 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  28.92 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>