44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4212 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3894  hypothetical protein  46.67 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  36.49 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  36.49 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  35.81 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  34.07 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  32.81 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  31.97 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  30.37 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  37.07 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  30.32 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  30.97 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  31.78 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  31.93 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  36.46 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  29.91 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  32.76 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  27.64 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  30.61 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  31.68 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  27.03 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  23.33 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  31.03 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  31.07 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  31.03 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  34.94 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  31.03 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  27.48 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  28.1 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2238  hypothetical protein  22.5 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000319661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  29.03 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  27.87 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  28.12 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  29.57 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  23.28 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  23.28 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  28.23 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2069  hypothetical protein  36.07 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.473334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  25.49 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  37.35 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  27.78 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  24.03 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  32.39 
 
 		 140 aa  40.8  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  31.91 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>